Microbiote intestinal : un allié discret au cœur de votre santé
24 novembre 2025
3 minutes de lecture
microbiote
Pileje
Digestion, défenses naturelles, humeur, sommeil… Derrière tous ces aspects du quotidien se cache un acteur encore trop méconnu : le microbiote intestinal. Cet ensemble de micro-organismes qui vit dans notre intestin n’est pas une simple curiosité scientifique : il est désormais considéré comme un véritable organe, au cœur de notre santé globale.
Dans le cadre de la campagne nationale « Ma santé passe par mes microbiotes », portée par le Laboratoire PiLeJe, les pharmacies Wellpharma vous proposent un décryptage clair pour mieux comprendre ce microbiote et apprendre à en prendre soin au jour le jour.
Article rédigé en partenariat avec
Laboratoire PileJe
Le microbiote intestinal, c’est quoi concrètement ?
On parle de microbiote intestinal pour désigner l’ensemble des bactéries, levures et autres micro-organismes qui vivent dans notre tube digestif. Chaque personne possède un microbiote unique, comme une empreinte digitale. Lorsqu’il est riche et équilibré, il participe au bon fonctionnement de l’organisme ; lorsqu’il est perturbé, on parle de « dysbiose », et certains troubles de santé peuvent apparaître ou s’aggraver.
Son rôle ne se limite pas à la digestion. Il participe aussi au maintien d’une barrière intestinale solide, capable de mieux filtrer ce qui doit passer dans l’organisme, et de bloquer ce qui pourrait lui nuire. Il intervient également dans le fonctionnement du système immunitaire, en aidant nos défenses à mieux reconnaître ce qui est dangereux de ce qui ne l’est pas.
Intestin, immunité, humeur : un dialogue permanent
On sait aujourd’hui que l’intestin et le cerveau sont en relation étroite. On parle souvent de l’axe intestin-cerveau. L’intestin envoie des signaux au système nerveux via des messagers chimiques et des voies nerveuses comme le nerf vague. Il produit aussi des substances impliquées dans la gestion du stress, de l’humeur et du sommeil.
C’est pour cela que l’on évoque parfois l’intestin comme un « deuxième cerveau ». Un microbiote perturbé peut se traduire par des troubles digestifs, mais aussi par une fatigue persistante, un moral en baisse ou un sommeil de moins bonne qualité. À l’inverse, un microbiote intestinal en équilibre peut contribuer à un meilleur bien-être général, en complément bien sûr d’une hygiène de vie adaptée et, si besoin, d’une prise en charge médicale.
Sur le plan immunitaire, le microbiote intestinal participe à l’entraînement de nos défenses naturelles. Il aide le système immunitaire à se développer, à se réguler et à mieux répondre aux agressions extérieures. C’est l’une des raisons pour lesquelles on s’intéresse de plus en plus au lien entre microbiote et certaines infections, allergies ou maladies inflammatoires.
Ce qui fragilise (et ce qui soutient) votre microbiote
Le microbiote intestinal est vivant, donc sensible à notre mode de vie. Plusieurs facteurs peuvent le déséquilibrer :
- une alimentation pauvre en fibres et riche en produits ultra-transformés,
- certaines prises de médicaments, notamment les antibiotiques,
- le stress chronique,
- le manque de sommeil,
- la sédentarité,
- la pollution et plus globalement notre environnement.
On regroupe l’ensemble de ces expositions sous le terme d’exposome : tout ce à quoi nous sommes confrontés au fil de notre vie (alimentation, environnement, stress, médicaments…) et qui influence notre santé et celle de nos microbiotes.
La bonne nouvelle, c’est qu’il est possible d’agir
Sans tout changer du jour au lendemain, de petites adaptations régulières peuvent faire une réelle différence :
- augmenter la part de fruits, légumes et légumineuses dans son assiette,
- privilégier les céréales complètes plutôt que raffinées,
- introduire des aliments fermentés (yaourt, kéfir, choucroute crue, miso…) si on les tolère bien,
- bouger un peu chaque jour, même sous forme de marche active,
- travailler sur la qualité du sommeil et des temps de récupération,
- limiter le stress par des techniques de relaxation, de respiration ou des activités qui font plaisir.
L’objectif n’est pas de viser la perfection, mais d’installer une routine réaliste, à votre rythme, pour soutenir l’équilibre de votre microbiote intestinal sur la durée.
Prébiotiques, probiotiques, psychobiotiques : comment s’y retrouver ?
On entend souvent parler de prébiotiques et de probiotiques, parfois de psychobiotiques, sans toujours bien comprendre la différence.
- Les prébiotiques sont des fibres particulières qui servent de « nourriture » aux bonnes bactéries de l’intestin. On les retrouve naturellement dans certains fruits et légumes, céréales complètes ou légumineuses.
- Les probiotiques sont, eux, des micro-organismes vivants que l’on peut apporter via certains aliments fermentés ou sous forme de compléments alimentaires. Selon les souches choisies, ils peuvent soutenir la digestion, les défenses naturelles ou d’autres fonctions.
- On parle de psychobiotiques pour désigner certaines souches de probiotiques qui font l’objet de recherches spécifiques sur le stress, l’humeur ou la qualité du sommeil.
Tous ces produits ne se valent pas et ne sont pas adaptés à toutes les situations. Les souches, les doses, la durée de prise et votre terrain (âge, pathologies, traitements en cours…) sont à prendre en compte. C’est pourquoi il est important de demander conseil à un professionnel de santé, notamment à votre pharmacien.
Le rôle de votre pharmacien Wellpharma
Votre pharmacien Wellpharma est un interlocuteur de proximité pour répondre à vos questions sur le microbiote intestinal. Il peut :
- vous aider à faire le point sur vos troubles digestifs éventuels et, si besoin, vous recommander une consultation médicale ;
- vous conseiller pour adapter progressivement votre alimentation et votre hygiène de vie afin de soutenir votre microbiote ;
- vous orienter, si cela est pertinent, vers des compléments à base de probiotiques ou d’autres solutions issues de laboratoires engagés dans la recherche sur le microbiote, comme PiLeJe, dans le respect de vos traitements en cours ;
- vous accompagner dans la durée, en ajustant les conseils en fonction de l’évolution de vos besoins et de vos objectifs de santé.
N’hésitez pas à lui en parler, même pour des questions qui vous paraissent « simples » ou un peu intimes : mieux comprendre votre microbiote, c’est déjà faire un premier pas pour prendre soin de votre santé globale.